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四季はあるが、春と秋は短く、冬が比較的長い。また季節の変わり方が急激で、5月に入るといきなり夏のように暑くなったり、9月になったとたん急に寒くなるといったこともある。
夏は、日中は海水浴ができるぐらい気温は上がるが、夜は冷えるので何か羽織るものが必要。また天候が変わりやすいので、常に雨具を持ち歩いていたい。ヴィリニュスは内陸部にあるので、タリンやリーガと比べ、冬は少し寒い。それでも-20度まで下がるのは稀。一般に雪は12月ぐらいから降り、たいてい3月までは積雪で覆われる。雪解けの頃、西部の河川下流地域では洪水が頻繁に起こるので要注意。夏は白夜の影響下に入り、夏至の前後は夜22:00頃まで明るい。逆に冬は16:00頃には暗くなる。